当将反渗透系统处理处于还原状态、且含有铁锰离子的原水时，设计者更应该注意防止铁锰氧化物形成的膜污染。这是因为原水在经过预处理氧化工艺处理后-即当水中氧含量在5PPM以上时，二价铁、锰离子会变成不溶性氢氧化物的溶胶，虽然一般情况下通过混凝、沉降及介质过滤等组合工艺可将该类污染物去除。然而，在实际的反渗透水处理工程中，铁在反渗透膜系统中污堵的产生案例往往很多。多年的工程实践表明，当原水PH值为7.7以上时，即便反渗透给水中铁含量为0.1PPM、且在SDI测试值小于5的情况下，也可能发生铁的膜污染问题，这是因为铁的氧化速率与铁含量，水中溶解氧的浓度及PH值等因素密切有关，所以在预处理系统中应注意对原水中铁离子含量的控制。工程实践证明：一般情况下，原水PH值较低时，反渗透给水中铁离子的允许含量可以稍高：在原水PH值<6.0，溶解氧含量<0.5ppm，原水铁含量在4ppm以下时，反渗透膜系统基本上不可能发生铁污染；当原水溶解氧含量在0.5- 5ppm之间，PH为6.0-7.0时，水中铁离子的安全允许含量应在0.5ppm以下；当原水溶解氧含量为5ppm以上，且PH >7.7时，反渗透给水中的铁离子的安全允许浓度仅为0.05ppm。另外，在处理含铁的地下水对原水进行氧化处理时，请勿采用加氯工艺，因为水中的铁在被氯化时所形成的胶体铁很难去除，进而对反渗透膜形成污染。

地下水中硫化氢可以通过氯化及氧化的方法将之去除，但该方法的实际效果与被处理水源的PH值密切相关。在原水PH低于6.4时，原水加氯可使硫化氢转变成硫酸成分存在与水中；但在原水PH值高于6.4时，在对原水氯化过程中，会有一部分硫化氢被氧化成胶体硫。工程实践证明：在PH为7~10时，两种反应成分约各占50%。然而，一旦原水系统中有胶体硫形成就非常难以去除，其对反渗透膜的污染较大，所以在实际反渗透工程应用中要特别谨慎。

　　另外，也可以使原水在进入反渗透系统之前，采用脱气或气提的方法将原水中的大部分硫化氢去除。